Pour virtualdub, il y a l'excellent Avidemux qui permet ausside réencoder un vidéo dans un autre format.
Sinon, tu as aussi Mplayer, Mencoder et Transcode mais ils font ca en ligne de commande mais c'est assez simple de trouver sur le net les lignes de commandes adéquates.
Il y a aussi Konverter pour convertir des videos dans un autre format, mais je ne l'ai jamais utilisé.
Tuxrip semble également être un programme très correct, il est développé par des membres de HFR.
Pour emule, j'utilise Mldonkey : en fait, tu lances le programme et il tourne en arrière plan, il n'a pas d'interface graphique. Pour pouvoir l'utiliser, il faut utiliser un navigateur et donc grâce à une interface web, tu peux tout faire : lancer des recherches et de dls, surveiller tes transferts...

J'aime bien ce principe.
Bittorrent (avec Azureus) ca roxe, mais c'est vrai que c'est moins sécurisé mais c'est bien plus rapide.
Pour EasyPHP, il faut installer directement Apache et une base de données.
Pour RealVNC, il existe des équivalents mais je ne peux pas t'en dire plus parce que je connais pas le sujet.